2009年，江蘇檢驗檢疫局繼續落實各項優惠政策、大力推動地方經濟發展，并出臺了五項措施幫助進口企業應對國際金融危機。這些措施包括：
一是建立24小時預約檢驗檢疫制度。對外公布江蘇檢驗檢疫部門預約檢驗檢疫電話和監督電話，保證出入境貨物及時檢驗檢疫和快速驗放。
二是減免收費，減輕企業負擔。在以往減免收費的基礎上，還對省級以上重點項目的進口大型成套設備的企業和產業集聚區等相關區域內具有自主出口品牌等條件的出口企業，由當地政府推薦并經報批后適當減收檢驗檢疫費。
三是大力幫扶進出口企業。進一步改革檢驗檢疫工作模式和方式，支持一批具有自主知識產權和品牌產品、高科技產品、一般貿易產品出口，推動江蘇外貿轉型升級；支持一批有實力的企業“走出去”，對企業對外投資輸出的人員、設備和原材料特事特辦，簡化手續；扶持一批傳統特色產品出口，提高出口產品質量和市場競爭力；積極支持擴大進口，對企業引進先進技術裝備、重要戰略資源和原材料，優先受理報檢，優先檢驗檢疫，優先放行。
四是營造便利通關環境。推進虛擬口岸直通放行制度，加強蘇南地區與上海、太倉口岸，蘇北地區和連云港口岸檢驗檢疫之間的合作，實現“一次申報、一次檢驗檢疫、一次放行”，推動江蘇省外向型經濟聯動發展；全力支持和參與江蘇電子口岸建設，加快口岸信息平臺的開發應用，提高口岸檢驗檢疫驗放速度，降低企業物流成本。
五是加強特殊監管區功能整合研究。推進特殊監管區從單一功能向綜合性多功能轉變，提高特殊監管區檢驗檢疫工作服務地方經濟發展的能力和水平。